De retour de la casa Velasquez à Madrid, Roger Blaquière séjourne en Bourgogne dans les belles terres de l’Auxois de 1960 à la fin de 1963 tout en continuant à être fréquemment présent aux Beaux-Arts de Paris.
En 1961, il obtient le deuxième second Grand Prix de Rome de peinture, année où son ami Joël Moulin obtient le premier et Vincent Bioulès le premier second.
Il peint quelques grandes toiles, mais surtout des oeuvres sur papier à l’aspect très architecturé.
Avec le temps, il garde pour cette période une grande sympathie car il considère que débutent là les premières oeuvres qu’il juge ayant quelque intérêt.
Pendant cette période, il expose régulièrement au salon de la Jeune Peinture et se trouve en compétition avec Cueco pour le prix du salon au printemps 1963.
Il obtient le premier Gand Prix de Rome en 1963 et débute une longue amitié avec le galeriste José Pichotin qui sera son marchand jusqu’en 1997, date à laquelle celui-ci cède sa galerie.
Cette période « bourguignonne » se clôt avec son installation à la Villa Médicis avec sa jeune femme en février 1964.